Online epidemic tracking tool embraces open data and collective intelligence

Online epidemic tracking tool embraces open data and collective intelligence
17:34 30 Noyabr 2016
Ölkə mətbuatı
A- A+

Researchers from the Wellcome Trust Sanger Institute and Imperial College London have developed Microreact, a free, real-time epidemic visualisation and tracking platform that has been used to monitor outbreaks of Ebola, Zika and antibiotic-resistant microbes. The team have collaborated with the Microbiology Society to allow any researcher around the world to share their latest information about disease outbreaks. Details of the platform are published in the journal Microbial Genomics today (30 November 2016).
 
Until now, disease data and geographic information about the movement of an infection or disease as it evolves and spreads has been locked up in databases that are often out of people's reach. Researchers have been left to rely on published information in research papers, which may be many months out of date, containing static visuals which show only a small part of the whole disease or infection threat.
 
Microreact is a cloud-based system that combines the power of open data and the web, to provide real-time global data sharing and visualisation, allowing anyone to explore and examine outbreak information with unprecedented speed and detail. This is becoming increasingly important in the race to monitor and control fast-developing outbreaks like Ebola or Zika, or the growing threat of anti-microbial resistance.
 
Microreact allows data and metadata sets to be uploaded via a web browser, which can then be visualised, shared and published in a research paper via a permanent web link. The partnership with Microbial Genomics allows the journal to make data from prospective publications available through Microreact. This promotes open availability and access while also starting to build a unique resource for global health professionals and scientists.
 
Dr David Aanensen, Director of the Centre for Genomic Pathogen Surveillance (a joint initiative between Imperial College London and the Sanger Institute) and one of Microreact's creators, said: "Until now, the global research community has been hamstrung because results are generally only shared in static pictures or tables in publications. Microreact allows everyone to explore the information dynamically - across both time and space - letting them see the whole picture. Using Microreact takes disease tracking out the hands of a privileged few and gives it to everyone who wants to understand disease evolution."
 
One example of how Microreact can democratise genomic data and resulting insights is the work of Dr Kathryn Holt and Professor Gordon Dougan. They have recently published two papers on the global distribution of typhoid bacteria around the world, showing the epidemic spread of a multidrug resistant strain. But they also published their data to Microreact to help others build on their work.
 
Dr Kathryn Holt, from the University of Melbourne, said: "We gathered together data from almost 2000 samples Salmonella Typhi bacteria collected by 74 collaborators in 63 countries. By comparing the different strains and mapping them to when and where they were 'caught' we were able to show that a new drug-resistant strain emerged in Asia and has spread across that continent and into Africa. We have put all this information on Microreact and now anyone can see exactly what we saw - both scientists and those public health professionals tasked with controlling such outbreaks."
 
By putting this information on Microreact, the researchers have ensured that the data continues to live on - allowing others to learn from their work and to use the information as a basis of comparison or foundation for future work. Microreact also allows individual researchers to share information globally and in real-time - crowdsourcing new discoveries and insights that could have immediate impact.
 
Leighton Chipperfield, Director of Publishing at the Microbiology Society said: "We are delighted that our open-access, open-data journal Microbial Genomics is partnering with Microreact. All Microreact projects that appear in Microbial Genomics papers will be highlighted on the journal's website to increase the discoverability and accessibility of researchers' datasets."


RƏYLƏR

BU KATEQORİYADAN DİGƏR XƏBƏRLƏR

Ölkə mətbuatında bugün »

Xərçəngin ilkin əlamətlərindən əvvəl onu aşkar etməyə imkan verən test hazırlandı

20 Avqust 2017 06:33

ABŞ-da mitinqdə 27 nəfər saxlanıldı

20 Avqust 2017 06:24

Ağdaşda 6 otaqlı ev yandı

20 Avqust 2017 06:09

SOCAR-ın Gürcüstandakı şirkətləri Borjomi Milli Parkında müxtəlif növ ağac əkiblər

20 Avqust 2017 06:03

Yupiterin əvvəllər görünməmiş fotoları nümayiş olundu - FOTOLAR

20 Avqust 2017 05:33

Peterburqda maşın izdihama çırpıldı: ölən və yaralananlar var

20 Avqust 2017 05:04

Pivə haqqında bilmədiyimiz — MARAQLI 5 FAKT

20 Avqust 2017 05:03

Kral 400 terrorçunu əfv etdi

20 Avqust 2017 04:49

“Facebook”da yeni reklam növü tətbiq olunacaq

20 Avqust 2017 04:33

"KamAZ" və ev yandı

20 Avqust 2017 04:19

İnsanları il ərzində ən az işləyən ölkələr - SİYAHI

20 Avqust 2017 04:03

Terrorçular Barselonada kilsəni partlatmaq istəyirmişlər

20 Avqust 2017 03:19

Bakı "İnter"ində futbolçuların maaşları ödənilib

20 Avqust 2017 03:17

Könül Xasıyevaya qarşı dələduzluq

20 Avqust 2017 03:08

Adriana ilə türk sevgilisi bu hala qaldılar - FOTOLAR

20 Avqust 2017 02:58

İspaniyadakı hücumun təşkilatçısı şəhərin imamı imiş

20 Avqust 2017 02:29

Bal ayına hazırlaşanlar, diqqət! - 10 ən maraqlı yer

20 Avqust 2017 02:28

Azərbaycanın varlı qızları bahalı avtomobilləri ilə... - VİDEO

20 Avqust 2017 02:03

İsrail baş naziri Rusiya prezidenti Vladimir Putinlə görüşməyi planlaşdırır

20 Avqust 2017 01:47

Ərdoğan Almaniya XİN rəhbərinə: "Həddini bil"

20 Avqust 2017 01:24

Azərbaycan neftinin SON QİYMƏTİ

20 Avqust 2017 01:23

Sumqayıt bulvarında qəribə qadağalar

20 Avqust 2017 01:19

"Səni hər gün daha çox sevirəm" - arvadından azərbaycanlı müğənniyə

20 Avqust 2017 01:03

Qara Qarayev: "Uğurlu nəticə ilə qayıdaraq adımızı tarixə yazdırmağa çalışacağıq"

20 Avqust 2017 00:52

Ağdaşda 6 otaqlı ev yanıb

20 Avqust 2017 00:50

Hovuzlar dənizdən daha təhlükəlidir? - VİDEO

20 Avqust 2017 00:43

Prezident: "Bir dənə də olsun təmirsiz kənd yolu qalmamalıdır"

20 Avqust 2017 00:29

Aslanlarla dostluq edən alim

20 Avqust 2017 00:26

“Neftçi” azarkeşlərindən növbəti etiraz – “İstefa”

20 Avqust 2017 00:23

Mingəçevirdə mikroavtobus qəzaya düşüb, xəsarət alan var

20 Avqust 2017 00:22

Astroloji proqnoz - 20 avqust

20 Avqust 2017 00:13

Kamerunda dəhşətli qəza

20 Avqust 2017 00:07

Avstraliyada naməlum şəxs avtomobili kütlənin üzərinə sürüb - 7 nəfər xəsarət alıb

19 Avqust 2017 23:58

Hikmət Hacıyev: “BMT Baş Katibinin çağırışını dəstəkləyirik”

19 Avqust 2017 23:54

Yaksək maaşlı iş axtaranlar, diqqət

19 Avqust 2017 23:54

Sabaha olan hava proqnozu - 36 dərəcə isti

19 Avqust 2017 23:38

26 yaşlı gənc bıçaqlandı

19 Avqust 2017 23:36

"Qarabağ"ın rəqibi "Kopenhagen" çümpionatda çətin qələbə qazanıb

19 Avqust 2017 23:32

Sızanaqları yox edən təbii maskalar - Aspirin, gil, darçın...

19 Avqust 2017 23:23

Bal ayına hazırlaşanlar, diqqət!

19 Avqust 2017 23:21

Barselonada müsəlmanlar etiraz etdilər

19 Avqust 2017 23:19

Samuxda “Yenikənd” yarımstansiyası istifadəyə verilib

19 Avqust 2017 23:07

"Futbolçuların 99,9 faizi “ulduz xəstəliyi”nə tutulur" - Qurban Qurbanov

19 Avqust 2017 23:07

"Yol infrastrukturuna görə Azərbaycan dünya miqyasında qabaqcıl yerdədir"

19 Avqust 2017 23:03

"Başlanğıcda başqa komandalarla oynamaq istərdik" - Zaur Svanadze

19 Avqust 2017 22:57

"Kopenhagen"dən əzmkar qələbə

19 Avqust 2017 22:57

Kənan Doğulu ilə Beren Saat Bodrumda - FOTOLAR

19 Avqust 2017 22:53

Qurban Qurbanov: "Bu gün Əfan komandaya faydalı oyunçudur"

19 Avqust 2017 22:52

Azərbaycanda belə toy olmamışdı: Bəylə gəlin hərbi formada

19 Avqust 2017 22:48

Hikmək Hacıyev: "Azərbaycan mülki insanlarının hədəfə çevrilməsindən ən çox əziyyət çəkən dövlətlərdən biridir"

19 Avqust 2017 22:47