Online epidemic tracking tool embraces open data and collective intelligence

Online epidemic tracking tool embraces open data and collective intelligence
17:34 30 Noyabr 2016
Ölkə mətbuatı
A- A+

Researchers from the Wellcome Trust Sanger Institute and Imperial College London have developed Microreact, a free, real-time epidemic visualisation and tracking platform that has been used to monitor outbreaks of Ebola, Zika and antibiotic-resistant microbes. The team have collaborated with the Microbiology Society to allow any researcher around the world to share their latest information about disease outbreaks. Details of the platform are published in the journal Microbial Genomics today (30 November 2016).
 
Until now, disease data and geographic information about the movement of an infection or disease as it evolves and spreads has been locked up in databases that are often out of people's reach. Researchers have been left to rely on published information in research papers, which may be many months out of date, containing static visuals which show only a small part of the whole disease or infection threat.
 
Microreact is a cloud-based system that combines the power of open data and the web, to provide real-time global data sharing and visualisation, allowing anyone to explore and examine outbreak information with unprecedented speed and detail. This is becoming increasingly important in the race to monitor and control fast-developing outbreaks like Ebola or Zika, or the growing threat of anti-microbial resistance.
 
Microreact allows data and metadata sets to be uploaded via a web browser, which can then be visualised, shared and published in a research paper via a permanent web link. The partnership with Microbial Genomics allows the journal to make data from prospective publications available through Microreact. This promotes open availability and access while also starting to build a unique resource for global health professionals and scientists.
 
Dr David Aanensen, Director of the Centre for Genomic Pathogen Surveillance (a joint initiative between Imperial College London and the Sanger Institute) and one of Microreact's creators, said: "Until now, the global research community has been hamstrung because results are generally only shared in static pictures or tables in publications. Microreact allows everyone to explore the information dynamically - across both time and space - letting them see the whole picture. Using Microreact takes disease tracking out the hands of a privileged few and gives it to everyone who wants to understand disease evolution."
 
One example of how Microreact can democratise genomic data and resulting insights is the work of Dr Kathryn Holt and Professor Gordon Dougan. They have recently published two papers on the global distribution of typhoid bacteria around the world, showing the epidemic spread of a multidrug resistant strain. But they also published their data to Microreact to help others build on their work.
 
Dr Kathryn Holt, from the University of Melbourne, said: "We gathered together data from almost 2000 samples Salmonella Typhi bacteria collected by 74 collaborators in 63 countries. By comparing the different strains and mapping them to when and where they were 'caught' we were able to show that a new drug-resistant strain emerged in Asia and has spread across that continent and into Africa. We have put all this information on Microreact and now anyone can see exactly what we saw - both scientists and those public health professionals tasked with controlling such outbreaks."
 
By putting this information on Microreact, the researchers have ensured that the data continues to live on - allowing others to learn from their work and to use the information as a basis of comparison or foundation for future work. Microreact also allows individual researchers to share information globally and in real-time - crowdsourcing new discoveries and insights that could have immediate impact.
 
Leighton Chipperfield, Director of Publishing at the Microbiology Society said: "We are delighted that our open-access, open-data journal Microbial Genomics is partnering with Microreact. All Microreact projects that appear in Microbial Genomics papers will be highlighted on the journal's website to increase the discoverability and accessibility of researchers' datasets."


RƏYLƏR

OXŞAR XƏBƏRLƏR

BU KATEQORİYADAN DİGƏR XƏBƏRLƏR

Ölkə mətbuatında bugün »

Ermənistanın təhlükəsi yenidən Avropanın diqqət mərkəzində

24 May 2017 00:49

Filippin prezidenti Rusiyaya rəsmi səfərini yarımçıq qoyub

24 May 2017 00:47

Venesuelada prezidentə qarşı etiraz aksiyalarında ölənlərin sayı 55-ə çatıb

24 May 2017 00:42

Bakıda 80 yaşlı qadın oğlu tərəfindən qəddarcasına döyülüb

24 May 2017 00:37

Cənubi Koreya-Şimali Koreya sərhədində silah səsləri eşidildi

24 May 2017 00:26

Biləsuvar RMX-nın baş həkimi işdən azad olundu

24 May 2017 00:24

123 mərtəbəli göydələndə dəhşətli anlar - VİDEO

24 May 2017 00:23

Afaq, Nərgiz və Tolik Bodrumda dincəlir - FOTO

24 May 2017 00:12

Astroloji proqnoz - 24 may

24 May 2017 00:08

Əlidən etiraf: "Kaş ki..." - VİDEO

24 May 2017 00:05

Günün qoroskopu: əsəb sisteminizə çox yük düşür

24 May 2017 00:05

Birmingemdə aksiya zamanı əlində bıçaq və dəyənək olan şəxs saxlanılıb

23 May 2017 23:57

Üz üçün “Minus 10" maskası

23 May 2017 23:57

Trampla çəkdirdiyi "selfi" israilli deputatın başına bəla oldu -

23 May 2017 23:56

Üç qız atası ilə evlənən 49 yaşlı xalq artistinin TOYUNDA NƏLƏR BAŞ VERDİ?

23 May 2017 23:53

Qarın bölgəsindəki pylərdən xilas edən içki

23 May 2017 23:52

Adams, Messi, Vardi... – Qanunsuzluğa əl atanlar

23 May 2017 23:52

Saçların yağlanmasına gətirən 6 səbəb

23 May 2017 23:47

Bu 3 dəstə İmam Zaman ağaya yardım edəcək

23 May 2017 23:42

"Barselona"nın sükanı arxasına keçəcək baş məşqçi hazırkı komandasından istefa verib

23 May 2017 23:37

Böyrək daşları və xalq təbabəti

23 May 2017 23:37

"Azərbaycan Beynəlxalq Bankı 2018-ci ildən tez özəlləşdirilməyəcək" - Nazir

23 May 2017 23:32

Məşhur gözəl Kann təqdimatında - FOTO

23 May 2017 23:32

Sevil-Sevinc bacıları maşınla vurduqları 87 yaşlı kişi haqda:

23 May 2017 23:31

Cocuq Mərcanlıda mina və qumbara tapıldı

23 May 2017 23:29

Baş ağrısından dərmansız qurtulmağın SADƏ YOLU

23 May 2017 23:27

Alman deputatlar Türkiyəyə getməkdən boyun qaçırdı

23 May 2017 23:23

Venesuelada etiraz aksiyası qurbanlarının sayı 55 nəfərə çatıb

23 May 2017 23:22

“Yasin” surəsi niyə Quranın qəlbidir?

23 May 2017 23:22

Zəvvarlarla dolu avtobus çaya düşdü - 22 ölü

23 May 2017 23:22

“VAZ” və “Opel” toqquşdu, yaralanan var

23 May 2017 23:19

Çiyələk yemək üçün 7 səbəb

23 May 2017 23:17

Alman deputatların Türkiyəyə səfər planı baş tutmadı

23 May 2017 23:14

Bu üsulla xoruldamağa son qoyulacaq

23 May 2017 23:13

Dua nədir?

23 May 2017 23:12

Sinəsini və ombalarını böyütdü - FOTO

23 May 2017 23:05

Deputat oğlunun işini araşdıran müstəntiq cəzalandırıldı - ƏMR

23 May 2017 23:05

İŞİD hücuma keçdi, Putinlə görüş təxirə salındı

23 May 2017 22:57

2 ədəd qoz sizin stressinizi asanlıqla aradan qaldıra bilər

23 May 2017 22:57

"Yaşka Bakinski" yataqda öldürüldü

23 May 2017 22:52

Əllərinizin xəbərdarlığına laqeyd qalmayın - FAYDALI MƏSLƏHƏT

23 May 2017 22:52

Hansı xalq təbabəti vasitələri ilə qanı durultmaq olar?

23 May 2017 22:52

Bənövşə yağının faydaları

23 May 2017 22:47

Mançester polisi terrorçunun şəxsiyyətini təsdiqlədi

23 May 2017 22:45

“La fəta illə Əli (ə)!”. Bəs fəta nə mənasındadır?

23 May 2017 22:42

Deputatlar Türkiyəyə getməkdən imtina etdilər

23 May 2017 22:39

“Gecə ovçusu” İŞİD terrorçularını belə məhv edir - VİDEO

23 May 2017 22:38

Fəxrəddin Manafov xanımı ilə - mediada ilk FOTOlar

23 May 2017 22:37

Çaya "cənnət toxumu" əlavə edin - FAYDALARI

23 May 2017 22:37

Şou ulduzu kurorta yollanıb - FOTO

23 May 2017 22:32