Online epidemic tracking tool embraces open data and collective intelligence

Online epidemic tracking tool embraces open data and collective intelligence
17:34 30 Noyabr 2016
Ölkə mətbuatı
A- A+

Researchers from the Wellcome Trust Sanger Institute and Imperial College London have developed Microreact, a free, real-time epidemic visualisation and tracking platform that has been used to monitor outbreaks of Ebola, Zika and antibiotic-resistant microbes. The team have collaborated with the Microbiology Society to allow any researcher around the world to share their latest information about disease outbreaks. Details of the platform are published in the journal Microbial Genomics today (30 November 2016).
 
Until now, disease data and geographic information about the movement of an infection or disease as it evolves and spreads has been locked up in databases that are often out of people's reach. Researchers have been left to rely on published information in research papers, which may be many months out of date, containing static visuals which show only a small part of the whole disease or infection threat.
 
Microreact is a cloud-based system that combines the power of open data and the web, to provide real-time global data sharing and visualisation, allowing anyone to explore and examine outbreak information with unprecedented speed and detail. This is becoming increasingly important in the race to monitor and control fast-developing outbreaks like Ebola or Zika, or the growing threat of anti-microbial resistance.
 
Microreact allows data and metadata sets to be uploaded via a web browser, which can then be visualised, shared and published in a research paper via a permanent web link. The partnership with Microbial Genomics allows the journal to make data from prospective publications available through Microreact. This promotes open availability and access while also starting to build a unique resource for global health professionals and scientists.
 
Dr David Aanensen, Director of the Centre for Genomic Pathogen Surveillance (a joint initiative between Imperial College London and the Sanger Institute) and one of Microreact's creators, said: "Until now, the global research community has been hamstrung because results are generally only shared in static pictures or tables in publications. Microreact allows everyone to explore the information dynamically - across both time and space - letting them see the whole picture. Using Microreact takes disease tracking out the hands of a privileged few and gives it to everyone who wants to understand disease evolution."
 
One example of how Microreact can democratise genomic data and resulting insights is the work of Dr Kathryn Holt and Professor Gordon Dougan. They have recently published two papers on the global distribution of typhoid bacteria around the world, showing the epidemic spread of a multidrug resistant strain. But they also published their data to Microreact to help others build on their work.
 
Dr Kathryn Holt, from the University of Melbourne, said: "We gathered together data from almost 2000 samples Salmonella Typhi bacteria collected by 74 collaborators in 63 countries. By comparing the different strains and mapping them to when and where they were 'caught' we were able to show that a new drug-resistant strain emerged in Asia and has spread across that continent and into Africa. We have put all this information on Microreact and now anyone can see exactly what we saw - both scientists and those public health professionals tasked with controlling such outbreaks."
 
By putting this information on Microreact, the researchers have ensured that the data continues to live on - allowing others to learn from their work and to use the information as a basis of comparison or foundation for future work. Microreact also allows individual researchers to share information globally and in real-time - crowdsourcing new discoveries and insights that could have immediate impact.
 
Leighton Chipperfield, Director of Publishing at the Microbiology Society said: "We are delighted that our open-access, open-data journal Microbial Genomics is partnering with Microreact. All Microreact projects that appear in Microbial Genomics papers will be highlighted on the journal's website to increase the discoverability and accessibility of researchers' datasets."


RƏYLƏR

OXŞAR XƏBƏRLƏR

BU KATEQORİYADAN DİGƏR XƏBƏRLƏR

Ölkə mətbuatında bugün »

Sosial media fenomenləri nə qədər qazanır?

24 İyun 2017 23:27

Rusiya - 3-cü “bədbəxt”

24 İyun 2017 23:27

Ürək və sinir sisteminin möhkəmlənməsi üçün kokteyl

24 İyun 2017 23:22

"Qəbələ"dən növbəti transfer -

24 İyun 2017 23:18

Gözün sağlamlığını qorumaq üçün 6 amil

24 İyun 2017 23:17

Dünya ulduzları Bakı Bulvarında oxudular - FOTO

24 İyun 2017 23:12

Qəlbin nurani olması üçün nə edək?

24 İyun 2017 23:12

Minskdə tank paradın məşqləri zamanı dirəyə çırpılıb

24 İyun 2017 23:12

Gəncədə yaşayış binasında yanğın - Sakinlər təxliyyə edildi

24 İyun 2017 23:08

Tennisi buraxdı, model oldu - FOTO

24 İyun 2017 23:05

Gəncədə binada yanğın olub

24 İyun 2017 23:04

Maşında ölü tapılan sevgililərlə bağlı təfərrüat - Qadın evli imiş

24 İyun 2017 22:57

Tesla musiqi servisini yaradır

24 İyun 2017 22:57

İlham Əliyevdən təbrik məktubu -

24 İyun 2017 22:56

Kamran Şahsuvarlı gümüş qazandı

24 İyun 2017 22:53

Türkiyənin ən məşhur adamının sirli qətli və oğurlanan istintaq materialı -

24 İyun 2017 22:52

İNANILMAZ: 26 yaşı var, 50 yaşında görünür - FOTOLAR

24 İyun 2017 22:49

Yumruğu 90 san ərzində sıxmanın maraqlı faydaları

24 İyun 2017 22:47

Sağlam Gələcək Mərkəzi "Müasir ailənin aktual problemləri” mövzusunda seminar keçirib

24 İyun 2017 22:47

Böyük sirləri özləri ilə o dünyaya aparan məşhurlar

24 İyun 2017 22:42

Mayeni gözlərindən ixrac edir -

24 İyun 2017 22:35

Məşhur hind aktrisa Mayamiyə yollanıb - FOTO

24 İyun 2017 22:32

Pakistandanda öldürülənlərin sayı 85-ə çatdı

24 İyun 2017 22:29

Azyaşlı, allergiyalı uşaqları necə qidalandırmaq lazımdır?

24 İyun 2017 22:22

İcra başçısının oğluna vəzifə verildi

24 İyun 2017 22:22

Bakıda yeni doğmuş anaya səhv qan köçürdülər - FOTO

24 İyun 2017 22:17

Hansı qida uşaqlarda IQ artırır?

24 İyun 2017 22:17

Qadın vəkilə qarşı əxlaqsız hərəkət

24 İyun 2017 22:12

"Həzm edə bilməyənlər, getsinlər, su içsinlər" - Hüseyn Əzizoğlu

24 İyun 2017 22:12

Qiyamət günü dənizlər atəş necə saçacaq?

24 İyun 2017 22:12

Londonda yaşayış binası yanıb

24 İyun 2017 22:12

Tarkan Bakıya təşəkkür etdi - FOTO

24 İyun 2017 22:05

Rus gözəl Neymarla tanış olmaq istəyir - FOTO

24 İyun 2017 22:05

İlhamənin anası əməliyyat olundu - FOTO

24 İyun 2017 22:05

“Qarabağ” hazırlıq oyununda darmadağın oldu

24 İyun 2017 22:05

Basqınlar və qətllər törətməkdə təqsirləndirilən şəxs azadlığa çıxdı

24 İyun 2017 22:04

İsrail o ölkəyə hava zərbələri endirdi -

24 İyun 2017 22:04

“Bu, rusların həyata keçirdiyi 11 sentyabr hücumudur” – ŞOK MÜQAYİSƏ

24 İyun 2017 22:03

Pakistanda partlayışlarda həlak olanların sayı 85 nəfərə çatıb

24 İyun 2017 21:57

PayPal-a ani pul köçürmələri funksiyası gəlib

24 İyun 2017 21:57

Siyəzəndə maşın maneəyə çırpılıb, yaralı var

24 İyun 2017 21:52

Piyada yeriməyin daha bir faydası

24 İyun 2017 21:52

Cənnət Allahın sevgisində, cəhənnəm qəzəbindədir

24 İyun 2017 21:52

Konfederasiyalar kuboku: Rusiya mübarizəni dayandırdı

24 İyun 2017 21:50

Azərbaycan prezidenti pakistanlı həmkarına başsağlığı verib

24 İyun 2017 21:48

Prezident Məmnun Hüseynə başsağlığı verdi

24 İyun 2017 21:44

Hepatit C xəstəliyi haqqında formalaşmış 7 YANLIŞ FİKİR

24 İyun 2017 21:42

Aktyora çevrilən 10 ulduz idmançı - FOTO

24 İyun 2017 21:42

Məhkəmə Messi qərarını verdi

24 İyun 2017 21:33

Açıq-saçıq şəkillər sonu oldu -

24 İyun 2017 21:33