Online epidemic tracking tool embraces open data and collective intelligence

Online epidemic tracking tool embraces open data and collective intelligence
17:34 30 Noyabr 2016
Ölkə mətbuatı
A- A+
Researchers from the Wellcome Trust Sanger Institute and Imperial College London have developed Microreact, a free, real-time epidemic visualisation and tracking platform that has been used to monitor outbreaks of Ebola, Zika and antibiotic-resistant microbes. The team have collaborated with the Microbiology Society to allow any researcher around the world to share their latest information about disease outbreaks. Details of the platform are published in the journal Microbial Genomics today (30 November 2016).
 
Until now, disease data and geographic information about the movement of an infection or disease as it evolves and spreads has been locked up in databases that are often out of people's reach. Researchers have been left to rely on published information in research papers, which may be many months out of date, containing static visuals which show only a small part of the whole disease or infection threat.
 
Microreact is a cloud-based system that combines the power of open data and the web, to provide real-time global data sharing and visualisation, allowing anyone to explore and examine outbreak information with unprecedented speed and detail. This is becoming increasingly important in the race to monitor and control fast-developing outbreaks like Ebola or Zika, or the growing threat of anti-microbial resistance.
 
Microreact allows data and metadata sets to be uploaded via a web browser, which can then be visualised, shared and published in a research paper via a permanent web link. The partnership with Microbial Genomics allows the journal to make data from prospective publications available through Microreact. This promotes open availability and access while also starting to build a unique resource for global health professionals and scientists.
 
Dr David Aanensen, Director of the Centre for Genomic Pathogen Surveillance (a joint initiative between Imperial College London and the Sanger Institute) and one of Microreact's creators, said: "Until now, the global research community has been hamstrung because results are generally only shared in static pictures or tables in publications. Microreact allows everyone to explore the information dynamically - across both time and space - letting them see the whole picture. Using Microreact takes disease tracking out the hands of a privileged few and gives it to everyone who wants to understand disease evolution."
 
One example of how Microreact can democratise genomic data and resulting insights is the work of Dr Kathryn Holt and Professor Gordon Dougan. They have recently published two papers on the global distribution of typhoid bacteria around the world, showing the epidemic spread of a multidrug resistant strain. But they also published their data to Microreact to help others build on their work.
 
Dr Kathryn Holt, from the University of Melbourne, said: "We gathered together data from almost 2000 samples Salmonella Typhi bacteria collected by 74 collaborators in 63 countries. By comparing the different strains and mapping them to when and where they were 'caught' we were able to show that a new drug-resistant strain emerged in Asia and has spread across that continent and into Africa. We have put all this information on Microreact and now anyone can see exactly what we saw - both scientists and those public health professionals tasked with controlling such outbreaks."
 
By putting this information on Microreact, the researchers have ensured that the data continues to live on - allowing others to learn from their work and to use the information as a basis of comparison or foundation for future work. Microreact also allows individual researchers to share information globally and in real-time - crowdsourcing new discoveries and insights that could have immediate impact.
 
Leighton Chipperfield, Director of Publishing at the Microbiology Society said: "We are delighted that our open-access, open-data journal Microbial Genomics is partnering with Microreact. All Microreact projects that appear in Microbial Genomics papers will be highlighted on the journal's website to increase the discoverability and accessibility of researchers' datasets."


OXŞAR XƏBƏRLƏR

BU KATEQORİYADAN DİGƏR XƏBƏRLƏR

Ölkə mətbuatında bugün

Havalar isinir – PROQNOZ

29 Mart 2017 13:14

ABŞ-ın patrul gəmiləri Qara dənizdə...

29 Mart 2017 13:09

Elza Seyidcahan: “Şeir gecəsi keçirəcəm, tezliklə kitabım da çıxacaq” - MÜSAHİBƏ

29 Mart 2017 13:08

Həbs edilən gözəl qız baxışları ilə "danışdı" - FOTO

29 Mart 2017 13:05

"Heç kim şoka-zada düşməsin, Cavanşirlə uzun illər..."

29 Mart 2017 13:05

Rusiya dövlət başçılarının ən mühüm sənədləri imzaladığı kabinetin İNANILMAZ SİRRİ

29 Mart 2017 13:03

"Neft Daşları" üçün yeni platforma istismara verildi

29 Mart 2017 13:01

Narkotik qaçaqmalçılığının qarşısı alındı

29 Mart 2017 12:59

Aeroport yolunda avtomobillərin hərəkəti qismən məhdudlaşdırıldı

29 Mart 2017 12:59

Aktyorun 8 illik sevgilisi gənc oğlanla kafedə tutuldu - FOTO

29 Mart 2017 12:57

ŞOK: naməlum varlıqlar peyda oldu, burada...

29 Mart 2017 12:56

Aparıcı mini ətək geyindiyini unutdu

29 Mart 2017 12:54

“Ayın o biri üzü”

29 Mart 2017 12:53

Bu yolda hərəkət etməyin

29 Mart 2017 12:53

Almanlar İncirliyə alternativlər tapdılar - SİYAHI

29 Mart 2017 12:53

Dəb ikonası sərgidə

29 Mart 2017 12:49

Teymur Məmmədov Avropa çempionu oldu

29 Mart 2017 12:47

Putin Rusiya hərbçilərinin sayını artırdı

29 Mart 2017 12:47

"Qəbələ"nin hücumçusu darmadağına töhfə verdi

29 Mart 2017 12:47

Moldova millimizlə oyun üçün heyəti açıqladı

29 Mart 2017 12:47

Qriqorçuk İngiltərə çempionu ilə görüş istədi

29 Mart 2017 12:47

Hitler, Xruşşov və Roma Papasını BİRLƏŞDİRƏN MƏQAM

29 Mart 2017 12:43

Aleyna 17 yaşını dostları ilə qeyd etdi - FOTO

29 Mart 2017 12:42

Fransadan gələn cərrah Xankəndində erməniləri pulsuz əməliyyat edir

29 Mart 2017 12:42

Bakının bu magistral yolunda hərəkət məhdudlaşacaq

29 Mart 2017 12:39

Putin Rusiya ordusunun heyətini genişləndirdi

29 Mart 2017 12:38

Sevdadan bahar gülüşlü FOTOSESSİYA

29 Mart 2017 12:37

Saatlarla dezodorantdan istifadə edən 12 yaşlı qız ölüb - FOTO

29 Mart 2017 12:37

"Neftçi" - "Qarabağ" - PROMO VİDEO

29 Mart 2017 12:37

“Thync Relax Pro” dincəlməyə və stressi aradan qaldırmağa kömək edəcək

29 Mart 2017 12:35

Ramin Hacılının evi yandı - FOTOLAR

29 Mart 2017 12:34

"Böyük dayaq" filmi haqqında Amil Xəlildən maraqlı araşdırma - İllər sonra bir İLK

29 Mart 2017 12:33

Dmitri Nazarov: "Bütün Avropa gördü ki..."

29 Mart 2017 12:32

Avtobus sürücüsü 20 yaşlı kar qızı zorladı - "Digər sürücü bizə baxıb gülürdü"

29 Mart 2017 12:32

Ermənilər hərbi təlim keçir - AĞDAMDA

29 Mart 2017 12:29

Canlı yayım zamanı "qar adamı"​ göründü

29 Mart 2017 12:29

Bakıda turistləri Tarix Muzeyinə buraxmadılar - İş günü qapıları bağladılar

29 Mart 2017 12:28

Roza Zərgərlinin qızı kinoya çəkildi - FOTOLENT

29 Mart 2017 12:24

Bankdan 40 milyon çıxarıb "Ferrari" almaq istəyən Dadaşova bacıları saxlanıldı - FOTOLAR

29 Mart 2017 12:23

Bülənt Ərsoy və qaynanası bir arada

29 Mart 2017 12:22

Baş konsulluq atəşə tutuldu - UKRAYNADA

29 Mart 2017 12:19

Sərnişin qatarının hərəkət qrafiki dəyişdi

29 Mart 2017 12:18

Ukraynadan Ermənistana “Eurovision” qadağası - FOTOLAR

29 Mart 2017 12:18

7 yaşlı övladını çəkiclə öldürən şəxslə bağlı ŞOK FAKTLAR - SİLAH, FƏRARİLİK, OĞURLUQ...1

29 Mart 2017 12:17

Renat Dadaşovla bağlı yeni İDDİA: millimizdən imtina edir

29 Mart 2017 12:17

İt sahibini öldürdü

29 Mart 2017 12:13

Bakıda şadlıq evi 12 milyon manata satışa çıxarıldı - FOTO

29 Mart 2017 12:12

“Qoşun və texnika lazımdır!” - Rusiyaya qarşı MÜHARİBƏ ÇAĞIRIŞI

29 Mart 2017 12:08

Azərbaycanlı bu məşhurlar evində ölü tapıldı

29 Mart 2017 12:08

105 illik rekord yeniləndi

29 Mart 2017 12:05